無法偵測 ppb 以下的極低濃度(Trace Levels):XRF 的偵測極限(LOD)通常落在 ppm 級別。若樣品含量低於 ppb 或 ppt 等級時(如:半導體等級的超純水分析),XRF 就無法準確量測,則需 改用 ICP-OES 或 ICP-MS。
無法偵測有機污染物:XRF 不能分析有機化合物中的化學鍵或官能基,因此,對於 RoHS 2.0 新增的有機化合物(如:塑化劑DBP、BBP、DEHP等),XRF 無法直接檢測,僅能篩檢重金屬與鹵素(如:溴、氯)進行篩檢。若是須快速檢測塑化劑,建議可以使用熱脫附質譜儀(TD-MS),或者是熱裂解氣相層析質譜儀(Py-GC-MS)。
厚度影響測試能力:XRF 的偵測深度有限(約 0.01µm 至 100µm),無法精確量測樣品內部深層成分,視材料而定,量測結果通常反映的是表面或淺層的成分;若樣品為多層電鍍且厚度過厚,X 射線可能無法穿透至底層基材;反之,若鍍層極薄,量測數據則會混合基材訊號,需透過演算法補償。
會受到樣品狀態限制:雖然可測固體、粉末或液體,但樣品表面若不規則、粗糙不平整或尺寸過小,會導致 X 射線產生不規則散射,增加量測誤差。通常固體樣品建議 偵測平整表面,或將粉末壓片處理以提高準確度。
非元素性質無法檢測:無法分析如分子量、熔點、顏色、生物活性等非元素相關的物理或化學性質。
無法做深度分析:XRF 獲得的是偵測範圍內的「平均含量」,無法像電子顯微鏡(SEM / EDX)或二次離子質譜(SIMS)那樣進行精確的 3D 深度剖面分析或微米 級的縱深分佈分析,例如 XRF 不能只偵測晶圓表面污染物。